Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5415E9PXF3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms