Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms