Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms