Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc62E9PVD1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms