Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms