Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms