Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Piezo1E2JF22 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Piezo1E2JF22 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Piezo1E2JF22 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Piezo1E2JF22 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Piezo1E2JF22 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Piezo1E2JF22 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Piezo1E2JF22 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms