Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cngb1E1AZ71 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms