Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms