Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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