Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms