Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42791D3YYB5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms