Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms