Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

Predictions only

Length 5,634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Hmcn1D3YXG0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hmcn1D3YXG0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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