Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rexo5D3YW29 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rexo5D3YW29 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms