Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim30cD3YVI9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms