Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm4950D3YUM8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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