Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms