Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms