Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms