Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms