Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms