Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms