Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms