Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed5B2RPU8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms