Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CK137956B1AYM9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms