Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms