Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms