Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms