Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PtprsB0V2N1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms