Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms