Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms