Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a4A2AX52 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a4A2AX52 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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