Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga8A2ARA8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga8A2ARA8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga8A2ARA8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms