Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms