Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms