Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms