Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FocadA2AKG8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms