Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a11A2AJN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms