Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Lcn6A2AJB9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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