Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ88

Pnpla7, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla7A2AJ88 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnpla7A2AJ88 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpla7A2AJ88 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms