Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm12A2AJ77 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms