Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap5A2AGT5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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