Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms