Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm884A2A9H6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm884A2A9H6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms