Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms