Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms