Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp1bA1Z198 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms