Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms