Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Scn2aA0A0J9YTW6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Scn2aA0A0J9YTW6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn2aA0A0J9YTW6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn2aA0A0J9YTW6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scn2aA0A0J9YTW6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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